MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia coli W plasmid pRK1

Total Repeats: 1674

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017637	CAA	2	6	732	737	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386611789
2	NC_017637	TCG	2	6	746	751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386611789
3	NC_017637	GTG	2	6	886	891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386611789
4	NC_017637	CAC	2	6	1058	1063	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386611789
5	NC_017637	CAG	2	6	1093	1098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386611789
6	NC_017637	CGA	2	6	1124	1129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386611789
7	NC_017637	A	6	6	1129	1134	100 %	0 %	0 %	0 %	386611789
8	NC_017637	AGCCTC	2	12	1181	1192	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386611789
9	NC_017637	AAC	2	6	1193	1198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386611789
10	NC_017637	CCT	2	6	1207	1212	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386611789
11	NC_017637	CGA	2	6	1221	1226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386611789
12	NC_017637	GAT	2	6	1295	1300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386611790
13	NC_017637	GTT	2	6	1368	1373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386611790
14	NC_017637	GAT	2	6	1401	1406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386611790
15	NC_017637	GTAA	2	8	1525	1532	50 %	25 %	25 %	0 %	386611790
16	NC_017637	AGT	2	6	1599	1604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386611791
17	NC_017637	ACC	2	6	1621	1626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386611791
18	NC_017637	AAGC	2	8	1631	1638	50 %	0 %	25 %	25 %	386611791
19	NC_017637	CTG	2	6	1678	1683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386611791
20	NC_017637	GGA	2	6	1692	1697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386611791
21	NC_017637	CAC	2	6	1730	1735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386611791
22	NC_017637	CTG	2	6	1807	1812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386611791
23	NC_017637	CCTG	2	8	1833	1840	0 %	25 %	25 %	50 %	386611791
24	NC_017637	CGC	2	6	1857	1862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386611791
25	NC_017637	GGT	2	6	1864	1869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386611791
26	NC_017637	GCA	2	6	1879	1884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386611791
27	NC_017637	CAT	2	6	1908	1913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386611791
28	NC_017637	ATT	2	6	1942	1947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386611791
29	NC_017637	TCG	2	6	1992	1997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386611791
30	NC_017637	CTG	2	6	2077	2082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386611791
31	NC_017637	AGA	2	6	2157	2162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386611791
32	NC_017637	CAC	2	6	2169	2174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386611791
33	NC_017637	GGCGCT	2	12	2187	2198	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386611791
34	NC_017637	CG	3	6	2211	2216	0 %	0 %	50 %	50 %	386611791
35	NC_017637	CAGGTG	2	12	2218	2229	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386611791
36	NC_017637	GCC	2	6	2236	2241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386611791
37	NC_017637	GGT	2	6	2257	2262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386611791
38	NC_017637	GTGGCG	2	12	2308	2319	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386611791
39	NC_017637	GCC	2	6	2431	2436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386611791
40	NC_017637	CTG	2	6	2437	2442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386611791
41	NC_017637	GCCGGA	2	12	2559	2570	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386611791
42	NC_017637	GAAC	2	8	2604	2611	50 %	0 %	25 %	25 %	386611791
43	NC_017637	TGA	2	6	2612	2617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386611791
44	NC_017637	ACG	2	6	2624	2629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386611791
45	NC_017637	CTG	2	6	2659	2664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386611791
46	NC_017637	GTG	3	9	2740	2748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386611791
47	NC_017637	TG	4	8	2766	2773	0 %	50 %	50 %	0 %	386611791
48	NC_017637	GTG	2	6	2780	2785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386611791
49	NC_017637	GAC	2	6	2815	2820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386611791
50	NC_017637	GGA	2	6	2859	2864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386611791
51	NC_017637	CTG	2	6	2878	2883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386611791
52	NC_017637	ACGC	2	8	2901	2908	25 %	0 %	25 %	50 %	386611791
53	NC_017637	GCA	2	6	2920	2925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386611791
54	NC_017637	GCA	2	6	2931	2936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386611791
55	NC_017637	CTG	2	6	2956	2961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386611791
56	NC_017637	ATT	2	6	3038	3043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386611791
57	NC_017637	GAAG	2	8	3069	3076	50 %	0 %	50 %	0 %	386611791
58	NC_017637	CTG	2	6	3124	3129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386611791
59	NC_017637	GAC	2	6	3153	3158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386611791
60	NC_017637	TCAG	2	8	3170	3177	25 %	25 %	25 %	25 %	386611791
61	NC_017637	TGG	2	6	3310	3315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386611791
62	NC_017637	CTT	2	6	3333	3338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386611791
63	NC_017637	GAA	2	6	3420	3425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386611791
64	NC_017637	TG	3	6	3488	3493	0 %	50 %	50 %	0 %	386611791
65	NC_017637	CAC	2	6	3494	3499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386611791
66	NC_017637	CAGA	2	8	3505	3512	50 %	0 %	25 %	25 %	386611791
67	NC_017637	GCC	2	6	3544	3549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386611791
68	NC_017637	TGA	2	6	3550	3555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386611791
69	NC_017637	TGA	2	6	3605	3610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386611792
70	NC_017637	ACTGA	2	10	3613	3622	40 %	20 %	20 %	20 %	386611792
71	NC_017637	TGC	2	6	3672	3677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386611792
72	NC_017637	TCAC	2	8	3701	3708	25 %	25 %	0 %	50 %	386611792
73	NC_017637	GAT	2	6	3744	3749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386611792
74	NC_017637	TC	3	6	3854	3859	0 %	50 %	0 %	50 %	386611792
75	NC_017637	TGG	2	6	3888	3893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386611792
76	NC_017637	CGT	2	6	3906	3911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386611792
77	NC_017637	CAT	2	6	4002	4007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386611792
78	NC_017637	AGG	2	6	4026	4031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386611792
79	NC_017637	GCC	2	6	4086	4091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386611793
80	NC_017637	GGCTGT	2	12	4097	4108	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386611793
81	NC_017637	AAC	2	6	4114	4119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386611793
82	NC_017637	GTC	3	9	4120	4128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386611793
83	NC_017637	CTTT	2	8	4165	4172	0 %	75 %	0 %	25 %	386611793
84	NC_017637	T	6	6	4218	4223	0 %	100 %	0 %	0 %	386611793
85	NC_017637	AGG	2	6	4240	4245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386611793
86	NC_017637	TGGC	2	8	4269	4276	0 %	25 %	50 %	25 %	386611793
87	NC_017637	TTC	2	6	4318	4323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386611793
88	NC_017637	CCGT	2	8	4356	4363	0 %	25 %	25 %	50 %	386611793
89	NC_017637	GCG	2	6	4382	4387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386611793
90	NC_017637	GCC	2	6	4423	4428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386611793
91	NC_017637	ACG	2	6	4448	4453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386611793
92	NC_017637	CTGGT	2	10	4541	4550	0 %	40 %	40 %	20 %	386611793
93	NC_017637	GTT	2	6	4551	4556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386611793
94	NC_017637	GAG	2	6	4557	4562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386611793
95	NC_017637	GTG	2	6	4589	4594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386611793
96	NC_017637	TCA	2	6	4614	4619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386611793
97	NC_017637	AGG	2	6	4639	4644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386611793
98	NC_017637	GGC	2	6	4654	4659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386611793
99	NC_017637	GTG	2	6	4687	4692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386611793
100	NC_017637	GAT	2	6	4724	4729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386611793
101	NC_017637	ATG	2	6	4754	4759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386611793
102	NC_017637	GGT	2	6	4826	4831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386611794
103	NC_017637	GGA	2	6	4840	4845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386611794
104	NC_017637	CTG	2	6	4847	4852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386611794
105	NC_017637	ACC	2	6	4865	4870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386611794
106	NC_017637	CTG	2	6	4928	4933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386611794
107	NC_017637	GAA	2	6	4991	4996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386611794
108	NC_017637	GCC	2	6	5117	5122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386611794
109	NC_017637	CCG	2	6	5186	5191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386611794
110	NC_017637	CAT	2	6	5247	5252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386611794
111	NC_017637	GTG	2	6	5282	5287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386611794
112	NC_017637	TGT	2	6	5818	5823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386611795
113	NC_017637	CTG	2	6	5829	5834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386611795
114	NC_017637	TGACC	2	10	5890	5899	20 %	20 %	20 %	40 %	386611795
115	NC_017637	TGA	3	9	5905	5913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386611795
116	NC_017637	CGC	2	6	5926	5931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386611795
117	NC_017637	GGA	2	6	6097	6102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386611795
118	NC_017637	TGG	2	6	6140	6145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386611795
119	NC_017637	GAG	2	6	6161	6166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386611795
120	NC_017637	CTG	2	6	6200	6205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386611795
121	NC_017637	TTC	2	6	7109	7114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386611796
122	NC_017637	TGT	2	6	7118	7123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386611796
123	NC_017637	AT	3	6	7132	7137	50 %	50 %	0 %	0 %	386611796
124	NC_017637	TCA	2	6	7177	7182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386611796
125	NC_017637	CCA	2	6	7223	7228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386611796
126	NC_017637	TCT	2	6	7302	7307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386611796
127	NC_017637	TCA	2	6	7403	7408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386611796
128	NC_017637	GTT	2	6	7443	7448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386611796
129	NC_017637	CCTCT	2	10	7583	7592	0 %	40 %	0 %	60 %	386611796
130	NC_017637	GCT	2	6	7621	7626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386611796
131	NC_017637	GAT	2	6	7802	7807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386611796
132	NC_017637	TCA	2	6	7849	7854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386611796
133	NC_017637	T	6	6	7923	7928	0 %	100 %	0 %	0 %	386611797
134	NC_017637	GC	3	6	8068	8073	0 %	0 %	50 %	50 %	386611797
135	NC_017637	AGCA	2	8	8135	8142	50 %	0 %	25 %	25 %	386611797
136	NC_017637	AGC	3	9	8150	8158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386611797
137	NC_017637	TGC	2	6	8175	8180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386611797
138	NC_017637	GAT	2	6	8327	8332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386611797
139	NC_017637	CAT	2	6	8341	8346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386611797
140	NC_017637	AGT	2	6	8356	8361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386611797
141	NC_017637	CAG	2	6	8496	8501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386611798
142	NC_017637	T	6	6	8513	8518	0 %	100 %	0 %	0 %	386611798
143	NC_017637	CAG	2	6	8611	8616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386611798
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145	NC_017637	TTA	2	6	8718	8723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386611798
146	NC_017637	TCGC	2	8	8887	8894	0 %	25 %	25 %	50 %	386611798
147	NC_017637	A	7	7	8922	8928	100 %	0 %	0 %	0 %	386611798
148	NC_017637	CCG	2	6	9041	9046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386611799
149	NC_017637	CG	3	6	9250	9255	0 %	0 %	50 %	50 %	386611799
150	NC_017637	AAG	2	6	9353	9358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386611800
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152	NC_017637	ACG	2	6	9368	9373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386611800
153	NC_017637	CGC	2	6	9378	9383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386611800
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156	NC_017637	TTG	2	6	9510	9515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386611800
157	NC_017637	ACC	2	6	9563	9568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386611800
158	NC_017637	GTTAC	2	10	9643	9652	20 %	40 %	20 %	20 %	386611800
159	NC_017637	GGC	2	6	9658	9663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386611800
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164	NC_017637	ATG	2	6	9917	9922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386611800
165	NC_017637	GCT	2	6	9925	9930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386611800
166	NC_017637	TGG	2	6	9951	9956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386611800
167	NC_017637	GCTG	2	8	10039	10046	0 %	25 %	50 %	25 %	386611800
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247	NC_017637	ACA	2	6	14745	14750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386611807
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252	NC_017637	GCTG	2	8	14922	14929	0 %	25 %	50 %	25 %	386611807
253	NC_017637	CAG	2	6	14949	14954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386611807
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256	NC_017637	CA	3	6	15119	15124	50 %	0 %	0 %	50 %	386611807
257	NC_017637	GAT	2	6	15139	15144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386611807
258	NC_017637	AGA	2	6	15213	15218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386611807
259	NC_017637	GCT	2	6	15298	15303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386611807
260	NC_017637	GCT	2	6	15316	15321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386611807
261	NC_017637	ACG	2	6	15379	15384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386611807
262	NC_017637	AGA	2	6	15464	15469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386611807
263	NC_017637	GTT	2	6	15535	15540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386611807
264	NC_017637	TAT	2	6	15599	15604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386611807
265	NC_017637	ACAA	2	8	15647	15654	75 %	0 %	0 %	25 %	386611807
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283	NC_017637	GTT	2	6	16621	16626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386611808
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295	NC_017637	ATC	2	6	17290	17295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386611808
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370	NC_017637	A	6	6	21560	21565	100 %	0 %	0 %	0 %	386611811
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380	NC_017637	T	6	6	23390	23395	0 %	100 %	0 %	0 %	386611813
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382	NC_017637	CAT	2	6	23461	23466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386611813
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384	NC_017637	TCTT	2	8	23515	23522	0 %	75 %	0 %	25 %	386611813
385	NC_017637	AAT	2	6	23621	23626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386611813
386	NC_017637	T	6	6	23660	23665	0 %	100 %	0 %	0 %	386611813
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388	NC_017637	TTA	2	6	23777	23782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386611814
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